Nahuelbuta cuenta con varias especies de anfibios, entre ellos varias especies endémicas, es decir, que sólo se encuentran en este lugar. Es el caso del Sapito de Contulmo (Eusophus contulmoensis), que sólo se encuentra en quebradas húmedas de Contulmo y sus alrededores. Otra especie que llama la atención y también tiene graves problemas de conservación, es la carismática Ranita de Darwin (Rinoderma darwinii).
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